МУИС-ийн төгсөх ангийн зарим оюутан 2011 онд кредит системт шилжихтэй холбогдон үүссэн төлбөрийн үлдэгдлийн асуудлаар гомдол гаргаж, сургуулийнхаа захиргаа болон БШУЯ-ны удирдлагад хандсан билээ. Гэвч тэдний гомдлыг хүлээж аваагүй учир тус сургуулийн төгсөх дамжааны оюутнууд өчигдөр суулт зарлалаа. Тэд сүүлийн нэг сарын хугацаанд дээрх асуудлаар сургуулийнхаа удирдлагуудад хүсэлт гаргаж, шаардлага